Pelgulinna Tervisemaja projekteeritakse ja ehitatakse spetsiaalselt meditsiiniettevõtete vajadusi silmas pidades. Seetõttu on erilist tähelepanu pööratud nii hoone tehnosüsteemidele kui ka siseviimistluse materjalide valikule. Läänemere hambakliiniku ruumide jahutamiseks on paigaldatud Mitsubishi Heavy Industries VRF-süsteem, samas kui ülejäänud hoonet jahutab katusel paiknev täiskomplektne külmamasin firmalt CF Chiller. Ruumide jahutuselementidena on kasutusel jahutuspalgid, mis tagavad ühtlase ja mugava sisekliima.